このミッションはIRBMさえ破壊すればクリアになるので、最低スコアはIRBMだけを破壊した場合に達成できると思われます。
問題は1次ミッションで破壊すべきか2次ミッションで破壊すべきかです。
1次ミッションのIRBMは2000PTSですが、これを破壊するにはサイロ200PTSを破壊する必要があるので、最低でも2200PTSです。これが5つあるので、11000PTSとなります。更に2次ミッションでIRBM1000PTSを3発落とすので、計14000PTSとなります。
2次ミッションで破壊した場合はIRBMは1000PTSとなります。最大6発出るので、計6000PTSとなります。
おそらく、この6000PTSが最低スコアです。
ただ、難易度が高いと2次ミッションで6発のIRBMを破壊するのは至難の業なので、達成できるのかは良く分かりません。
(難易度ACEでの6発破壊にはまだ成功していません)